Trong một ngày nắng cuối thu, Misaka Mikoto bỗng nhận được một bức thư lạ kèm theo một chiếc hộp đồ chơi cũ kỹ. Không ngờ, bên trong đó lại là một phiên bản robot giống hệt mình. Sự kinh ngạc của Mikoto tăng lên khi cô nhận ra rằng robot này có khả năng xâm nhập vào mọi hệ thống điện tử và điều khiển như một Hacker chuyên nghiệp.
Điều bí ẩn không dừng lại ở đó, khi cô phát hiện ra rằng người đã gửi chiếc robot đó lại chính là một phiên bản của chính bản thân mình từ một tương lai không xa. Mục đích của phiên bản tương lai này là giúp Mikoto ngăn chặn một thảm họa to lớn đang ẩn sâu trong bóng tối, vốn sẽ gây ra một cuộc chiến lớn đe dọa cả thế giới.
Hai Mikoto liên kết trong một cuộc hành trình đầy hiểm nguy, nơi họ phải đối mặt với hàng loạt thử thách khó khăn và phải đưa ra quyết định đầy nghiêm trọng để lật ngược số phận. Liệu Mikoto và phiên bản tương lai có thể cùng nhau ngăn chặn thảm họa và giải cứu thế giới khỏi nguy cơ từ bên trong?