Trên con đường mòn đầy cát bụi, Hiori và Lucario từng bước đi với tâm trạng căng thẳng. Họ biết rằng ở phía trước, Lily đáng yêu của mình đợi chờ sự giải cứu từ đôi bàn tay của họ. Trong bóng tối của đêm, khi cả hai chìm sâu trong suy tư, một âm thanh khẽ khàng vang lên từ phía trước. Hiori quay đầu nhìn và không thể tin vào điều mình thấy: Team Galactic đang giữ Lily như một con tin.
Mặc kệ nguy hiểm, Hiori và Lucario tấn công mạnh mẽ, nhưng bất ngờ khi phát hiện Team Galactic đã chuẩn bị kế hoạch dành cho họ. Một cảnh tượng kỳ bí hiện ra, Lily bỗng dưng phát ra ánh sáng mạnh mẽ từ bên trong cơ thể. Đó không phải là Lily quen thuộc, mà là một nguồn năng lượng lạ kỳ mà Team Galactic muốn sử dụng để chinh phục thế giới.
Với sức mạnh chưa từng thấy, Lily biến đổi hoàn toàn. Hiori và Lucario phải đối diện với một thử thách mới, đánh bại "Phantom Lily" để cứu em gái mình khỏi kiểm soát của Team Galactic. Trong sự hiểu biết và tình thế hiểm nghèo, liệu Hiori và Lucario có thể vượt qua mọi trở ngại và giải cứu Lily khỏi sự thảm họa sắp xảy ra?