Trước sự ra đi bí ẩn của ông lão sư Koji, ngôi nhà cấp 4 bắt đầu hé lộ những bí mật kinh hoàng chưa từng được tiết lộ. Kaito, dường như là con người duy nhất có thể giải quyết sự hỗn loạn trong ngôi nhà, thì đã bị cuốn vào vòng xoáy của các sự kiện không lường trước.
Miwa, cô gái mắt ướt, bỗng trở nên lạnh lùng và xa cách khi một vẻ bí ẩn bao phủ trái tim nhỏ bé của cô. Những người hàng xóm trước đây luôn vui vẻ và hòa đồng giờ đều giấu giếm một bí mật đen tối, khiến cuộc sống của Kaito dần trở nên phức tạp hơn.
Trong khi mọi người vẫn đang bị ám ảnh bởi sự mất tích của ông lão sư Koji, Kaito lần theo dấu vết và bất ngờ phát hiện ra một căn phòng bí mật ẩn sau tủ sách cũ kỹ. Trong căn phòng đó, những bức tranh cổ xưa được vẽ lên tường, cùng với một cuốn nhật ký cũ kỹ, tiết lộ những bí mật kinh hoàng của ngôi nhà.
Truyền thuyết về "Ngôi Nhà Huyền Bí" và người sáng lập ra nó dần được hé lộ, kéo theo những sự kiện không lường trước. Kaito bắt đầu nhận ra rằng sự linh thiêng của ngôi nhà không chỉ là do bí mật từ quá khứ mà còn liên quan đến tương lai của chính mình và những người xung quanh.