Trong một đêm trăng sáng trên mái nhà, Jun đột ngột nhận được một lá thư mới từ người cha đã mất của mình. Bức thư viết rằng: "Hãy đem sự sống đến cho họ". Bên trong hộp thư đầy bí ẩn đó, Jun khám phá ra một búp bê mới lạ, có đôi mắt xanh biếc sâu thẳm như ánh sáng lấp lánh giữa đêm tối.
Không ngờ rằng, búp bê đó không phải là bất kỳ một búp bê nào khác, mà chính là Shinku - một Rozen Maiden huyền bí từ thế giới khác. Từ lúc Jun trở thành chủ nhân của Shinku, cuộc sống của anh bước vào những trận đấu đầy kịch tính với các búp bê máy khác để giành lấy sự sống.
Trải qua những thử thách cam go, Jun dần hiểu được rằng bên trong những vỏ bọc bí ẩn của các Rozen Maiden không chỉ là sự khát khao sống mà còn là những khao khát tình thân, tình bạn và tình yêu chân thành. Anh phát hiện ra rằng, mỗi búp bê đều mang trong mình một số đau thương, một ẩn bất kỳ và một khao khát tồn tại và được yêu thương.
Những ngày dần trôi qua, tình cảm giữa Jun và Shinku không chỉ dừng lại ở mức độ chủ nhân và búp bê mà còn trở thành một sợi liên kết vững chãi giữa hai linh hồn hoàn toàn khác biệt. Jun học được rằng, sự sống không chỉ đơn giản là việc tồn tại mà còn là việc biết trân trọng, biết yêu thương và biết hy sinh cho nhau. Và từ đó, mỗi trận đấu của các Rozen Maiden không chỉ là cuộc chiến mà còn là một hành trình tìm kiếm ý nghĩa cuộc sống và niềm vui đích thực giữa vũ trụ siêu nhiên.