Trở thành một ninja không hề dễ dàng như Rantarou từng tưởng. Cuộc sống của cậu trai trẻ hoàn toàn bị đảo lộn khi gặp phải Kirimaru và Shinbee - đôi bạn hậu đậu nhưng có tấm lòng chân thật. Rantarou thường xuyên rơi vào những tình huống hài hước nhưng cũng không thiếu những trận đánh nguy hiểm, khiến cậu phải vận dụng tất cả khả năng và trí tuệ để thoát khỏi.
Tuy nhiên, một ngày, khi đội bạn vô tình bị bắt cóc bởi một nhóm ninja đen tối, Rantarou phải đối mặt với thử thách lớn nhất từ trước đến nay. Để giải cứu Kirimaru và Shinbee, cậu quyết định tìm đến trạm huấn luyện ninja huyền thoại, nơi truyền thống và bí mật được lưu truyền qua hàng thế hệ.
Dưới sự dẫn dắt của Hattori Sensei - một viên quản gia tài năng và khôn khéo, Rantarou phải đối mặt với các thử thách vô cùng nguy hiểm và căng thẳng. Nhưng liệu cậu có đủ sức mạnh và kiên nhẫn để vượt qua, hoặc mọi nỗ lực của cậu sẽ chỉ là thất bại khác? Điều gì đang chờ đợi phía trước, và liệu Rantarou có thực sự trở thành một ninja hoàn hảo như nguyện vọng ban đầu hay không?
