Trong một buổi tối u ám tại Học viện công nghệ Nekomi, Keiichi Morisato bỗng cảm thấy bất an khi bước về căn phòng không gian hẹp của mình. Đột nhiên, tiếng chuông điện thoại reo lên, và cậu bắt máy không màng suy nghĩ. "Trung tâm nữ thần giải quyết rắc rối, chúng tôi đến cứu bạn" - một giọng nữ trầm thấp vang lên từ bên kia dây nói. Keiichi hoang mang, nghĩ rằng đó chỉ là trò đùa của bạn bè. Nhưng khi cậu nói ra điều ước vô tình: "Tôi muốn có một người bạn ở bên cạnh mỗi ngày", một ánh sáng rực rỡ tỏa ra, và Belldandy xuất hiện trước mắt cậu - một nữ thần xinh đẹp với ánh mắt ấm áp và nụ cười nhẹ nhàng.
Từ đó, cuộc sống của Keiichi bắt đầu thay đổi hoàn toàn. Những mảnh ghép về quá khứ bí ẩn và về tương lai không ngờ dần dần hé lộ qua sự xuất hiện của Urd và Skuld, hai chị em của Belldandy. Tình bạn, tình cảm và trách nhiệm được đặt dưới ánh sáng của những bí mật vốn nằm sâu kín. Sự hiển nhiên trở nên mơ hồ, và Keiichi phải đối diện với những quyết định khó khăn để bảo vệ những điều quan trọng nhất trong cuộc đời của mình.