Trên ngọn đồi tĩnh lặng của Gensokyo, Hieda no Akyuu ngồi trước cuốn biên niên kỉ, ánh mắt nhìn mơ màng vào xa xăm. Kí ức về thế giới siêu nhiên xưa cũ đổ dồn về trong tâm trí cô như những mảnh ghép hỗn độn. Tuy rằng cô đã sống hàng trăm năm, lòng tự trọng của mình vẫn còn ngập tràn những hoài niệm về những ngày tháng trẻ thơ.
Một ngày, khi Hieda đang mải mê viết nhật ký, một ánh sáng lạ kỳ xuất hiện giữa không gian trước mặt cô. Cánh cổng giữa thế giới của loài yêu tinh và thế giới con người mở ra, và từ đó, một cô gái lạ mặt bước ra.
Với bí mật về quá khứ của Gensokyo và sứ mệnh bí ẩn cần giải mã, cuộc hành trình của Hieda cùng cô bạn mới bắt đầu. Những âm mưu, bí ẩn và những tấm vé tiếp theo tới từ quá khứ đang chờ đợi họ. Liệu cô gái lạ mặt có là khóa giải cuối cùng cho bí ẩn của Gensokyo hay chỉ là một người qua đường trong cuộc phiêu lưu của Hieda?