Trong Tokyo Kareshi, chàng hot boy trường Akihiko luôn tự tin vào khả năng quyến rũ mọi cô gái xinh đẹp xung quanh. Tuy nhiên, cuộc đời anh bị đảo lộn hoàn toàn sau khi gặp phải Misaki - một cô gái học cùng lớp với vẻ ngoài ngốc nghếch và hành động kỳ quặc. Misaki không chút quan tâm đến sự quyến rũ của Akihiko, thậm chí còn thẳng thắn chỉ trích anh mỗi khi cảm thấy anh đang làm phiền.
Mặc dù ban đầu chỉ coi Misaki như trò hề, nhưng Akihiko dần phát hiện ra bí mật đằng sau gương mặt ngốc nghếch đó. Misaki không phải cô gái bình thường, mà thực tế là một thiên tài toán học tài năng. Sự thông minh và tinh quái của cô khiến Akihiko không thể rời mắt khỏi cô.
Cuộc sống học đường của họ dần biến thành một cuộc sống kỳ thú, đầy tiếng cười và sự đối đầu đầy hấp dẫn. Akihiko nhận ra rằng đằng sau vẻ ngốc nghếch đáng yêu đó là một trái tim ấm áp và ý nghĩa, từ đó mối quan hệ giữa họ bắt đầu phát triển theo một hướng mới, mãnh liệt và đầy bất ngờ.
