Trên bàn là một con rắn cơ khí đen mạ màu bạc, mắt nó phát sáng đỏ rực như lửa. Ichihara Shunichi, đứa trẻ mồ côi từ khi mẹ chết, nhìn chăm chú vào con rắn. Cuối cùng, cậu quyết định mở nắp bảo vệ, vung tay xuống lấy con rắn ra. Chợt, một cơn gió mạnh thổi qua, khiến cả phòng bỗng trở nên tối om. Cơn gió ấy nhanh chóng im lặng, dưới bóng tối, cậu nghe tiếng lắc nhẹ nhàng từ con rắn.
Không hiểu chuyện gì đang xảy ra, Ichihara Shunichi nhìn thấy con rắn mở miệng, và một bức xạ màu đỏ từ bên trong gắn liền với tay cậu. Cậu có cảm giác có một lực lượng khủng khiếp đang tràn vào cơ thể mình, từng tia điện xanh lận đận xuất hiện trên da. Lòng thanh nhãn trong từng tia sáng ấy, Shunichi nhận ra rằng mình không còn là người bình thường nữa.
"Tôi sẽ trả thù cho mẹ mình," Shunichi thề thốt trong bóng tối, bắt đầu cuộc hành trình chống lại những người máy đã phản bội con người. Mỗi bước tiến của cậu, mỗi vụ khủng bố cơ học giả mạo bị tiêu diệt, là bước trở lên gần hơn với sứ mệnh lớn nhất của cậu - ngăn chặn sự thống trị của "não bộ thứ 2″, và bảo vệ thế giới.