Trong một ngày đông giá rét, ánh nắng mặt trời len lỏi vào căn biệt thự lớn theo kiểu phương Tây ở Tokyo thời Taisho Era. Okiku, cô gái vụng về từ nông thôn, vừa bước chân vào căn gác u tối, nơi mà ánh sáng không thể tiếp cận. Bằng cách nào đó, ánh sáng đã chiếu rọi trên một chiếc hộp gỗ cũ kỹ, phản chiếu ra một vẻ đẹp cổ điển và bí ẩn. Cô mở nắp hộp và bất ngờ phát hiện ra một con búp bê gốm tưởng chừng như bình thường.
Nhưng khi Okiku chạm vào búp bê, một luồng năng lượng huyền bí truyền vào cơ thể cô, khiến cô ngã gục. Khi mở mắt, Okiku nhận ra mình đang đứng giữa một không gian kỳ quái, nơi mà những chiếc búp bê coben như hồn thở và họ tự gọi mình là Rozen Maiden. Chúng kể cho cô về một âm mưu đen tối đang âm thầm hình thành và cần sự can thiệp của một người ngoài hành tinh như Okiku để ngăn chặn. Liệu cô có đủ can đảm và khả năng để đứng lên chống lại thế lực đen tối ẩn sau vẻ ngoài yên bình của thế giới?