Trong một thế giới tưởng tượng, hai nữ chiến binh mạnh mẽ từ hai vũ trụ khác nhau đã phải đối diện với một thế lực hắc ám đe dọa cả hai thế giới. Nanoha, cô cảnh sát pháp thuật với trái tim nhân từ từ Mahou Shoujo Lyrical Nanoha, và Madoka, cô nhà thám hiểm có sức mạnh lớn từ vũ trụ Madoka, đã phải hợp tác với nhau trong cuộc chiến quyết liệt.
Nanoha, dẫn đầu bởi lòng hiếu kỳ và trách nhiệm, đã mở ra khả năng mới mạnh mẽ của mình để đối phó với kẻ thù bí ẩn. Trái ngược với đó, Madoka mang theo sức mạnh chưa được khai phá của mình, đầy nghi ngờ và sợ hãi trước tương lai không rõ ràng.
Trải qua bao khó khăn và thử thách, Nanoha và Madoka dần hiểu ra rằng sức mạnh thật sự không chỉ đến từ khả năng chiến đấu mà còn từ tinh thần đoàn kết và lòng tin vào nhau. Sự kết hợp của họ đã tạo nên một phép thuật mạnh mẽ, đánh bại thế lực hắc ám và cứu vớt cả hai thế giới.
