Những tia sáng xanh lấp lánh tỏa rực từ cánh cửa mở ra, hé lộ một thế giới kỳ bí nơi mà không gian và thời gian dường như không còn giới hạn. Sora, Donald và Goofy ngẩng đầu nhìn quanh, ánh mắt đầy sự kinh ngạc và cảnh giác. Họ không thể lường trước được mọi thứ, cũng như những điều bất ngờ sẽ đến với họ.
Trong một góc tối, một hình bóng mờ nhạt vươn lên, tiến gần dần với họ. Đó không phải ai khác, đó chính là Roxas - người đã từng gắn bó mật thiết với Sora qua những kí ức của anh. Ánh mắt anh sáng rực lên, hơi thở nặng nhọc, Roxas dừng lại trước mặt Sora và lên tiếng: "Sora, chúng ta không thể chỉ đứng yên và chờ đợi. Hãy tập trung, vì giờ đây Kingdom Hearts đang đe dọa tất cả chúng ta."
Sora cảm thấy lòng mình rúng động, những kí ức cũ dần trỗi dậy. Nhưng trước khi anh kịp phản ứng, một sự kiện bất ngờ khác đã xảy ra. Cánh cửa phía trước đột ngột mở ra, để lộ một cảnh tượng khủng khiếp đang đợi họ phía bên trong. Và từ sâu bên trong, một tiếng rên rỉ xa xăm vang lên, khiến Sora và đồng đội phải chuẩn bị cho một cuộc chiến không thể dễ dàng hơn nữa...