Trong một ngôi trường nổi tiếng với những học sinh tài năng, có một cô gái tên Sakura. Cô là một nghệ sĩ violin tài năng, nhưng điều đặc biệt là cô có khả năng đặc biệt - cô có thể nhìn thấy linh hồn của những người đã từng chơi cây đàn violin của mình. Mỗi linh hồn đều mang đến cho Sakura một bài học quý giá về âm nhạc và cuộc sống.
Một ngày, sau một buổi tập violin mệt mỏi, Sakura bỗng cảm thấy mình mất đi sự linh hồn của mình. Trong bối cảnh mù lòa, cô phải đối mặt với một thử thách lớn - Liệu Chúa đã đòi hỏi sự hy sinh nào cho tài năng mà Người ban tặng cho cô?
Với sự hỗ trợ từ những linh hồn đã từng chơi cây đàn cùng cô, Sakura đã phải đối diện với quá khứ, vượt qua nỗi sợ hãi và tìm ra câu trả lời cho bí mật ẩn sau khả năng đặc biệt của mình. Cuối cùng, cô nhận ra rằng sự hy sinh không chỉ đến từ nỗ lực và tâm hồn mà còn từ sự hiểu biết về chính bản thân mình và sự trân trọng đời sống.
Kamisama no Sonata không chỉ là câu chuyện về âm nhạc và tài năng, mà còn là hành trình tìm kiếm bản thân và ý nghĩa của sự hy sinh trong cuộc sống.