Trên một thế giới song song khác, Deadpool, phiên bản từ một thế giới khác, đột ngột xuất hiện với một nhiệm vụ mới: tiêu diệt Deadpool chính hắn. Không phải vì hận thù, mà bởi vì tồn tại của Deadpool nguy cơ đe dọa cả vũ trụ.
Deadpool chính bắt đầu hành trình truy đuổi phiên bản khác của mình, đối mặt với những tình huống nguy hiểm, thử thách mà chỉ Deadpool mới có thể vượt qua. Trên đường đi, anh phát hiện ra nhiều bí mật đen tối về quá khứ của mình, về nguồn gốc của sức mạnh vô song mà anh sở hữu. Những phần ký ức mờ mị, những ý nghĩa sâu kín sẽ được hé lộ trong cuộc đối đầu gay cấn giữa Deadpool và chính mình.
Với viễn cảnh vũ trụ đang lung lay, liệu Deadpool có thể đánh bại bản sao của mình trước khi thời gian cạn kiệt? Hay sẽ có một kết thúc không ngờ đến khi hai bên cùng hợp tác để thay đổi số phận của cả vũ trụ? Đó chính là câu chuyện về sự phản bội, tình bạn và sứ mệnh cứu thế trong Deadpool Kills Deadpool.