20 năm sau khi "Ánh Sáng Vĩ Đại" rời khỏi trái đất, thế giới đã chìm trong yên bình đặc trị, những hồi ức về cuộc chiến chống lại Aliens dần trở thành những trang lịch sử xa xôi. Tuy nhiên, Hayata, bộ trưởng quốc phòng Nhật Bản xưa nay là một thành viên chìm trong đội SSI tiết lộ một sự thật chấn động: Ultraman vẫn tồn tại, nhưng không phải ở dạng người anh hùng mà là trong hơi thở của con trai anh, Shin.
Khám phá này khiến Hayata bắt đầu hồi tưởng lại những âm mưu đã bị ném vào bóng tối, những bí mật chôn giấu sâu dưới địa ngục tưởng chừng đã chấm dứt. Shin, mang trong mình sức mạnh của chiến thần bất bại, đã từng tích tụ dị năng mà ai khác cũng không thể hiểu được. Anh chàng trẻ tuổi, hứng thú với những phiêu lưu đi tìm công lý, đang dần nhận ra rằng khi sức mạnh được dùng với mục đích đúng đắn, nó có thể thay đổi cả một thế giới.
Trước khi Ultraman tái xuất, Hayata phải trải qua một cuộc đấu tranh nội tâm, giữa trách nhiệm của một người cha và nhiệm vụ bảo vệ trái đất. Liệu cuộc truyền kỳ mới này sẽ tiếp tục vang lên như một tia hi vọng trong biển bão, hay sẽ chìm vào quên lãng giống như những dấu vết cũ? Kẻ thù mới đã sẵn sàng báo thù, Shin và Ultraman sẽ phải đối mặt với những thử thách mới, nếu không, sẽ rơi vào vòng xoáy của hủy diệt không thể đoán trước được.
